1、肩颈疾病：肩井是经常容易出现局部酸痛的位置，经常按摩肩井穴可以治疗颈肩不适，也可以用于缓解颈椎病症状；
2、上肢疾病：上肢出现酸痛、麻木可能是上肢疾病引起，也可能与颈椎病、肩关节疾病有关，可以通过肩井穴进行治疗；
3、落枕：大部分由于斜方肌紧张引起，肩井位于斜方肌上束，因此落枕可以通过肩井穴治疗；
4、乳腺疾病：针刺或按摩肩井穴可有效刺激乳房，改善乳汁不通或乳腺炎的症状。
肩井穴治疗疾病主要以按摩为主，针刺该穴位会有一定风险，因为肩井下方就是肺尖，采用针刺一定要把握分寸，一般不能超过0.5寸。